Najstarsza wzmianka pisana dotycząca poznańskiej siedziby biskupów pochodzi z 1404 r., wzniesionego dla biskupa Wojciecha Jastrzębca, chociaż dwór biskupi istniał zapewne od początku funkcjonowania katedry.
W XV i XVI w. następowały kolejne rozbudowy i przebudowy dokonywane przez kolejnych biskupów.
W czasie potopu szwedzkiego rezydencja została zniszczona, została odbudowana przez biskupów Wojciecha Tolibowskiego i Stefana Wierzbowskiego.
Podczas III wojny północnej dwór popadł w ruinę i został odbudowany i przebudowany za czasów biskupa Jana Tarły w 1730. na barokowy pałac. Kolejne poważniejsze przebudowy miały miejsce w latach 1827–1830 oraz w II połowie XIX w.
W okresie międzywojennym odbudowano jedno ze skrzydeł pałacu, zniszczone w okresie powodzi.
Pałac wielokrotnie niszczony w czasie wojen lub powodzi zmieniał w ciągu wieków swój kształt architektoniczny.
Wojny północne :
I wojna północna (1563–1570) – konflikt zbrojny pomiędzy Rzecząpospolitą obojga narodów, Szwecją, państwem moskiewskim, Danią i Lubeką o podział Inflant.
II wojna północna (1655–1660) – wojna pomiędzy Szwecją sprzymierzoną z Brandenburgią, Siedmiogrodem i magnatem litewskim Januszem Radziwiłłem a Rzecząpospolitą (potop szwedzki) oraz później także Austrią, Danią, Holandią i Brandenburgią.
III wojna północna (1700–1721) – wielka wojna północna, wojna pomiędzy Danią, Rosją, Saksonią, Prusami i Hanowerem a Szwecją.