Kanał został wykonany na obszarze tzw. Bydgoskich Łąk Nadnoteckich, które znajdują się częściowo w depresji względem poziomu wody w kanale.
W Dębinku znajduje się wodny węzeł rozrządowy, gdzie na odcinku 600 m poprzez dwie śluzy i trzy jazy następuje podział nurtu wodnego, w sposób umożliwiający regulację na dwie odnogi:
– jedną zasilającą Noteć
– drugą poprowadzoną do Kanału Bydgoskiego
Za pomocą śluz statki pokonują spad wynoszący 13,68 m w kierunku Kanału Bydgoskiego.
